Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ID3Q02535 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ID3Q02535 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms