Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
DSC2Q02487 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms