Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms