Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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