Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM4P67936 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM4P67936 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM4P67936 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM4P67936 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM4P67936 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM4P67936 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM4P67936 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM4P67936 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM4P67936 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM4P67936 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM4P67936 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM4P67936 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM4P67936 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms