Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms