Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLH1P40692 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms