Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PPARGP37231 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PPARGP37231 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PPARGP37231 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PPARGP37231 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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PPARGP37231 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PPARGP37231 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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