Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTN2P35609 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms