Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms