Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms