Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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PTPRMP28827 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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PTPRMP28827 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
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