Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms