Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO2P25791 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms