Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCM3P25205 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCM3P25205 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms