Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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PRKCHP24723 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PRKCHP24723 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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PRKCHP24723 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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PRKCHP24723 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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