Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms