Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms