Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms