Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 TRAF3IP3-201ENST00000367023 1065 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 WT1-AS-206ENST00000525436 1254 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AC069208.1-206ENST00000538905 832 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AC048382.1-201ENST00000542197 1018 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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HOXB3P14651 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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