Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GLI3P10071 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GLI3P10071 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GLI3P10071 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GLI3P10071 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GLI3P10071 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GLI3P10071 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms