Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGFRP00533 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGFRP00533 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGFRP00533 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGFRP00533 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGFRP00533 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGFRP00533 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGFRP00533 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGFRP00533 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGFRP00533 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGFRP00533 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGFRP00533 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGFRP00533 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGFRP00533 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms