Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN11O75508 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms