Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB3O43889 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms