Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms