Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNTN3Q9P232 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNTN3Q9P232 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNTN3Q9P232 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNTN3Q9P232 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNTN3Q9P232 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNTN3Q9P232 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CNTN3Q9P232 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CNTN3Q9P232 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CNTN3Q9P232 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CNTN3Q9P232 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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