Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms