Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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