Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms