Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCO2Q9BYV7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms