Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms