Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms