Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms