Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms