Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms