Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms