Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms