Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms