Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms