Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ZNF248Q8NDW4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ZNF248Q8NDW4 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF248Q8NDW4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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