Protein–RNA interactions for Protein: Q6J4K2

SLC8B1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1Q6J4K2 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC8B1Q6J4K2 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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