Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM41BQ5BJD5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms