Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms