Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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