Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms