Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms