Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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