Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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