Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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