Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PMS2P11Q13670 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PMS2P11Q13670 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PMS2P11Q13670 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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PMS2P11Q13670 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PMS2P11Q13670 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PMS2P11Q13670 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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